オーストラリアの動物健康管理および食肉安全システムは、概して全国レベルで整合されてはいますが、このような管理制度を直接に規制するのは州政府の役割です。
連邦政府は動物健康管理および疫病撲滅プログラムを担当し、国際的な影響に対応できるよう、政策、州間の調整、戦略的なアプローチに対する責任を担っています。州政府はそれらの政策の実施を担当しています。以下が州政府の関係省庁です。
担当範囲には、残留化学物質の管理、農場における外来疾病および風土病の抑止、個体識別、動物福祉などが含まれます。