オーストラリアでは、輸出肉を生産しない国内向け専門の加工場は、AQISへの登録を免除されています。それに代わって、これら加工場は各州の食肉安全当局へ自主的に登録することが出来ます。
こういった州当局とAQISとの間には適合証明の取り決めが存在し、輸入国がその制度を認めれば、州政府に登録している加工場からの製品も輸入することが可能です。
食肉安全に係る州当局は以下の通りです。